通辽市蒙医医院成立于1980年，是一所集蒙医药医疗、教学、科研为一体的蒙医综合医院，也是通辽市唯一一家蒙医科研研究机构,全院占地面积11652平方米，建筑面积10344平方米。1984年被国家民委、卫生部和自治区政府列为国家民族医药重点建设单位，2012年被自治区卫生厅评为“二级甲等蒙医医院”，2015年被国家中医药局评为“三级乙等民族医院”。
医院现有职工246人，其中编制100人，自聘人员146人，专业技术人员占94%、博士4名、硕士59人、副高级以上人员33人、自治区名医6人、通辽市名医8人，国家非遗传承人1人、通辽市非遗传承人2人，自治区民族团结先进个人2人。临床科室29个，疗区8个、医技科室3个、蒙药制剂室1个，蒙医药研究室1个，开放床位300张。现有美国GE的3.0T核磁共振、128排（256层）高端CT等100余件大中型现代医疗设备。目前，我院拥有国家级特色优势专科1个、自治区级特色优势重点专科6个、市级特色优势重点专科3个。
经过多年的努力，我院现已发展成为特色鲜明，功能齐全，集科研、教学、医疗为一体的综合性民族医院。为数以万计的农牧民解决了病痛之患；为蒙医药领域发展培养了大批综合性专业人才；继承和创新了多种传统蒙医疗法。在特色科室建设和科研项目方面取得了显著成果和宝贵经验。
我院始终坚持突出蒙医药特色的办院方针，本着“突出特色、推动全面”的指导思想，不断加强专科专病建设和特色专科建设，努力打造专科优势和特色品牌。目前设有肾病、脾胃病、传统整骨、传统疗术等重点专科。其中肾病专科和传统整骨专科，通过医护人员几十年如一日的孜孜探索和共同努力，已成为我院乃至通辽市的特色和优势品牌，使来自全国各地的患者朋友们慕名而来，满意而归。2012年成立的传统疗术科，通过恢复和创新针灸、沙疗、药浴、按摩等传统蒙医疗法，在疑难杂症治疗和病后康复方面取得了显著成果，得到广大患者一致认可。在此基础上，我院不断壮大蒙医康复中心，治未病中心、脾胃专科、心脑血管内科、蒙医外科、呼吸内科、神经内科、颈腰椎专科、肝病专科、肛肠专科等等，不断提高特色优势和综合服务能力，取得了良好的社会效益和经济效益。
医院迁址新建项目列入国家中医药创新建设目录以及通辽市“十四五”发展规划。项目统一规划、分期建设，占地面积62.48亩，建筑面积9.43万㎡，将打造一所500张以上床位，集医疗、预防、康复、科研、教学为一体的高标准三级甲等蒙医综合医院。一期将完成5.95万㎡，投资2.98亿，已于2023年7月14日动工，预计2025年投入使用。
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